最强文档格式转换工具，能按照期刊论文模板生成manuscript

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最强文档格式转换工具，能按照期刊论文模板生成manuscript

如何在Word2007中使用Endnote

如何在word中利用endnote进行文献管理

ctex写好的论文如何快速换成别的杂志模板格式

一、最强文档格式转换工具，能按照期刊论文模板生成manuscript

没有什么工具是 All in One，Obsidian 也是如此。但是 Obsidian 的强大之处就是轻量级、双向链接、MD 语法、与其他工具的联动，可以用于科研笔记、知识管理，笔者做科研写论文主要是使用 Obsidian，再联动几个工具，就能极大提高科研写作效率。

本期是 Obsidian+Zotero 联动做科研系列的第 35 集，主要分享一个非常强大实用的格式转换插件—— Pandoc。这个插件添加了命令板选项，可以帮助科研人将 markdown 文件转换为 Microsoft Word、PowerPoint、 Jupyter Notebook、HTML、PDF、LaTeX、Wiki、EPUB 格式。

Pandoc使您可以在 Markdown中编写演示文稿、草拟书籍、制作网页、编写 SCI 论文和毕业论文，并导出为您需要的任何格式，所有这些都无需离开 Obsidian。

Obsidian的文档格式简单，没有那么多的字体、字号、间距等格式让你选择，可以让我们专注于写作。但 Pandoc 可以让你根据论文模板，将文档转换成符合格式要求的文档，例如设置好毕业论文的模板，我们就可以将obsidian 上的文档转换成符合毕业论文、SCI论文格式的 word 文件了，这完全不需要我们手动排版。这是不是很神奇！

Pandoc第三方插件安装

Pandoc 是第三方插件，具体安装方法和其它第三方插件一样，可以通过插件社区下载（最新版本的 Obsidian 已经可以支持浏览和下载插件了），或者通过我们提供的第三方插件包安装插件。

下图是通过插件社区安装 Pandoc 的示例。在社区搜索 pandoc，会给出 3 个导出相关的插件，但是最好用的还是 Pandoc 插件。如果您对其它导出插件感兴趣，可以研究研究。

安装完 Pandoc 插件以后，我们还需要进行配置，如下图所示。Pandoc 插件重点需要配置两个参数：导出文件夹和 Pandoc 路径。

• 导出文件夹，这个很好理解，就是转换后的文件保存的地方。

• Pandoc 路径，这里的 Pandoc 是一个工具，需要下载安装到电脑上。换而言之，第三方插件Pandoc 是依赖 Pandoc 工具实现其转换功能的。

以上两个参数缺一不可，否则都会导致文件转换失败，其它参数可以忽略。

文档格式转换工具 Pandoc

Pandoc 是一款免费的文档格式转换工具，堪称该领域的神器。Pandoc 是一个由 John Mac Farlane 开发的通用文档转换工具，可以支持大量标记语言之间的格式转换，例如 Markdown 、Microsoft Word、PowerPoint、 Jupyter Notebook、HTML、PDF、LaTeX、Wiki、EPUB 格式之间的相互转换。

Pandoc 支持非常多的格式；关键它还是一个开源免费的工具，源代码放在了 GitHub 上，使用 Haskell 编程语言实现。

Pandoc 为 Windows 系统提供了编译后的 msi 安装包，可以直接运行安装；或者直接下载免安装的 zip 文件解压即可。

Pandoc 工具下载地址是：

https://github.com/jgm/pandoc

Pandoc的用法

Pandoc 的用法并不复杂，下面给出 Pandoc 的基本使用方法。

• 按 Ctrl+P/Cmd+P 显示命令面板。当然也可以通过左侧按钮打开命令面板。

• 在命令面板的搜索栏搜索 “Pandoc” 选择您的导出格式，如下图所示。

• 如果一切顺利，它会提示成功指示。

• 如果您将名为 Pandoc.md 的文件导出为 Word 文档，则在您的文件资源管理器中，同一文件夹中将有一个 Pandoc.docx 文件。

至此，Pandoc转换 md 文件到 doc 文件的操作就完成了。同理，您也可以实用 Pandoc 转换 md 文件到 PDF、PPT 等等，这里就不做详细介绍了。如果您还有疑问可以直接留言，笔者会及时回复。

这里多说几句，Obsidian 也提供了导出功能，如下图所示。Obsidian 可以 导出PDF，但是笔者总是在导出的过程中卡住，从没有成功过。Obsidian 导出 PDF 失败的具体原因并不清楚，但是笔者都是使用的 Pandoc 导出 PDF，就不会出现这种问题。

如果要使用第三方插件 markmind 绘制思维导图，那么可以使用 markmind 导出 html 文件，不要使用 Pandoc 导出思维导图的 html 文件。

写在最后

本期，笔者主要是分享了一个非常好用的 Obsidian 第三方插件——Pandoc！这个第三方插件也是笔者使用了众多插件后，一直保留的最实用的实用插件。这个插件非常复杂，但是它的功能很好地弥补了 Obsidian 的文件转换需求。

到目前为止，笔者认为Pandoc 是不可替代的，是非常好用的 markdown 文件转 word 工具，笔者每次使用 Obsidian 编辑文档后，都会使用 Pandoc 转换为 word 文件，即使是 SCI 论文、毕业论文、网文也可以使用Pandoc 转化完成，具体实现细节会留到以后推文分享给大家。

大家如果想了解更多关于 Obsidian+Zotero 的内容，可以关注投必得学术，点赞本文，也可以留言给我们。笔者接下来会分享更多 Obsidian 的用途，帮助大家更好地使用 Obsidian，用 Obsidian 帮助大家更好地阅读、写作和学习。

一、如何在Word2007中使用Endnote

word强大的文字处理功能，广泛用于文字性较多的排版，如图书排版、说明书排版。
　　word2007 中引入了Word Reference Builder的特性，其管理引用文献的功能和EndNote是相互竞争的。但目前Word2007的Reference管理功能还不是很成熟(1) Reference引用和输出格式可调整性还比较差，citation的模板也比较少(2)不能和SCI、EI等文献检索机构实现互联(3)不方便在阅读 referenced paper的同时，整理读书笔记以及关联pdf文档。
　　所以在以后一段时间内，还是推荐使用EndNote来做自己的文献索引和bibliography的管理。下面step-by-step介绍如何将EndNotes X作为add-in和Word2007整合：
　　在Word2007里，用alt+F打开File菜单，然后点击“Word选项”按钮 在弹出的“Word选项”对话框里，在左侧区域选择“信任中心”。然后在右侧区域点击“信任中心设置”按钮 在弹出的“信任中心”对话框里，在左侧区域选择“受信任位置”。然后激活右侧区域里的“...\Microsoft\Word\Startup Word 2007默认位置：启动” 注意这个路径就是用来放置word启用时加载的那些add-in的地方。记住这个url。并在explorer里打开它。 关闭所有正在运行的Word, Outlook 等office组件 再用一个explorer,导向到EndNote X的安装目录，如C:\Program Files\EndNote X 从到EndNote X的安装目录下，找到文件EN10CWYW.dot和EN10Cwyw.WordXP.wll。 将这两个文件拷贝到step 4打开的word startup folder。 启动Word2007。在Add-in加载项菜单里就可以看见EndNote X的工具栏了。
　　如果觉得EndNote自带的Connection和Template还不够丰富，可以到如下链接去下载
　　文章链接：EndNote使用简介
　　文献管理和论文写作的利器！虽然讲的是7.0的使用，对8.0的变化也不大
　　EndNote
　　简 介
　　Endnote 由Thomson Corporation下属的Thomson ResearchSoft 开发。 Thomson Researc
　　hSoft是以学术信息市场化和开发学术软件为宗旨的子公司。Thomson Corporation总部位
　　于美国康涅狄格州的Stamford。
　　Endnote的功能
　　一、在线搜索文献：直接从网络搜索相关文献并导入到Endnote的文献库内
　　二、建立文献库和图片库：收藏，管理和搜索个人文献和图片、表格
　　三、定制文稿：直接在Word中格式化引文和图形，利用文稿模板直接书写合乎杂志社要求的文章
　　功能一 在线搜索文献
　　Endnote利用Z39.50信息获取协议可以方便进入全世界绝大多数的文献数据库，并将连接和搜索这些数据库的信息用“Connection Files”的形式储存起来直接提供给使用者。 Con nection Files的设置可以自己创建或修改
　　搜索过程：
　　1.进入Endnote7.0，从“Tools”菜单下点击“Connect”
　　2.出现“Choose A Connection File”对话框，选定数据库，点击“Connect”
　　3.按照布尔逻辑设定搜索词，点击“Search”
　　4.出现搜索结果，存入指定的文献库
　　提示：
　　1.通过点击“Find” 进行查找设置可以提高对某一类型数据库的查找效率
　　2.很多数据库需要输入帐号和密码
　　3.“ Save Search”可以保存搜索设置；“Load Search”可以导入已保存的搜索设置；“
　　Add Field” 和“Delete Field”分别添加和删除设置栏
　　功能二 管理库内文献

　　一、导出文献

　　EndNote库内的文献可以以4种格式导出：Rich Text Format (RTF), HTML, XML, 和 plain text documents（TXT）。从而创建独立的文献集或者创建可以导入到其他数据库的参考文献。导出的文献样式由当前样式决定，当前样式可以从“Edit”菜单下的“Output Styles”或者工具栏上的样式下拉框选定。
　　导出步骤：
　　1.选定要导出的文献库
　　2.按照自己的要求排列文献的顺序
　　3.选择合适的文献样式
　　4.从 “File”菜单下点选“Export”.
　　6.出现导出对话框，选择要保存的文件格式.rtf .html .XML .txt 和文件名
　　7. 保存
　　注意: 如果文献库内有图像的话，图像将不会随之导出。只能另外粘贴。

　　二、导入文献

　　EndNote可以将不同来源的文献导入到已存在的库内或新建的库中：
　　A. Online searching： 即通过EndNote直接进入网上数据库查找和获得文献
　　B. Direct Export：很多网络数据库如MEDLINE、Pubmed、CSA等都支持将自己选择的文献
　　以EndNote可识别的格式下载
　　C. CD-ROM：将CD内的文献转换为文本格式以后通过滤镜导入
　　滤镜：滤镜用于导入网络数据库、CD-ROM和任何含有能够说明文件内信息的标签的文本文档。实际上“Connection files”里也含有滤镜。滤镜的功能是在导入时使EndNote能够解读常规的数据资料，相当于一个解读器。它将文献资料内的信息投射到EndNote 相应的信息域。由于每个特定的数据库都是由供应商以各自的数据组织方式提供的，因此即使供应商相同，每个数据库都需要一个特定的滤镜，不能混用。EndNote自带的滤镜已经经过设定，可以导入相应数据库的资料。使用者也可以编辑滤镜或新建以适应新的数据库或者自用。
　　文本文献的导入过程：
　　1. 创建EndNote可以导入的文本文件：文件必须是“标注格式（Tagged Format）”的.txt文档，即不同的信息必须以特定的标注（如Tab键、//等记号）分隔归类，每一个标注及其后面的信息都另起一行。自己创建相当麻烦。多数数据库支持将其数据资料转换为Tagged格式。如何转换见滤镜选择对话框下面的“Comments”内容或者“帮助”里的“ImportFormat”。如Pubmed的文献转换为：
　　PMID- 15492285
　　OWN - NLM
　　STAT- In-Process
　　DA - 20041019
　　IS - 0008-5472
　　VI - 64
　　IP - 20
　　DP - 2004 Oct 15
　　TI - CC chemokine ligand 25 enhances resistance to apoptosis in CD4+ T cells
　　from patients with T-cell lineage acute and chronic lymphocytic leukemia
　　by means of livin activation.
　　PG - 7579-87
　　AB - We investigated CD4 and CD8 double-positive thymocytes, CD4(+) T cells from typical patients with T-cell lineage acute lymphocytic leukemia(T-ALL) and T cell lineage chronic lymphocytic leukemia (T-CLL), and MOLT4 T cells in terms of CC chemokine igand 25 (CCL25) functions of induction of resistance to tumor necrosis factor alpha (TNF-alpha)-mediated apoptosis.
　　AD - Department of Immunology, and Laboratory of Allergy and Clinical Immunology, Institute of Allergy and Immune-related Diseases and Center for Medical Research, Wuhan University School of Medicine, Wuhan, Republic of China.
　　FAU - Qiuping, Zhang
　　AU - Qiuping Z
　　FAU - Jei, Xiong
　　AU - Jei X
　　FAU - Youxin, Jin
　　AU - Youxin J
　　LA - eng
　　PT - Journal Article
　　PL - United States
　　TA - Cancer Res
　　JID - 2984705R
　　SB - IM
　　EDAT- 2004/10/20 09:00
　　MHDA- 2004/10/20 09:00
　　AID - 64/20/7579 [pii]
　　AID - 10.1158/0008-5472.CAN-04-0641 [doi]
　　PST - ppublish
　　SO - Cancer Res 2004 Oct 1564(20):7579-87.
　　2. 点选“File”菜单里的“Import”，出现Import对话框
　　1) 点击“Choose File”选择要导入的文献数据
　　2) 选择“Import Options”下拉菜单里各项：
　　EndNote Library: 将EndNote的一个文献库导入到另一个文献库。映像不会随之转移，导入完成过后需要将该映像文件拷贝到新文献库内。
　　EndNote Import: 将从网络数据库下载或从EndNote导出并转换成EndNote格式的文本导入到新的EndNote文献库。
　　Refer/BibIX: 将从Refer 或 BibIX程序导出的文本导入到EndNote
　　ProCite: 将从ProCite 导出的文本导入到EndNote
　　Tab Delimited: 用于导入信息域已经被跳格键（Tab）分隔的文本
　　Reference Manager (RIS): 可导入从Reference Manager, Reference Update, Referenc e Web Poster 和其他任何RIS 格式资源导出的文档。用EndNote 也可以打开Reference Manager 的文献库。
　　ISI-CE: 导入来自于ISI数据资源的文本文档
　　Multi-filter (Special): 用于导入含有不同来源文献的文档 EndNote generated XML: 用于从EndNote导出的XML 格式的文件
　　Other Filters: 进入“Choose A Filter”对话框看到EndNote自带的大量滤镜，对应于不同的网络数据库。记住每个数据库都需要一个特定的滤镜，即使供应商相同也不可混用。
　　Use Connection File:可以将一个connection file作为滤镜。当用EndNote的Connect命令搜索某一数据库时会生成Connect.log文件，将此文件导入成文献库数据。该Connect.log 应该包含all references from your previous session。
　　3) 选择“Duplicates”下拉菜单：
　　Import All:导入所有文献，包括与目的库内有重复的文献
　　Discard Duplicates: 导入文献时剔除与目的库内有重复的文献
　　Import into Duplicates Library: 导入文献到目的库，但将所有重复文献放入一个名为“File-Dupl.enl”的库中，“File”是目的库的库名。使用者可以在稍后浏览这些文献或者合并两个库。
　　4) 选择“Text Translation”菜单：通常选择“No Translation”，只有机读目录(美国国会图书馆发行的磁带版图书目录，即MARC格式)的文档选择“ANSEL”
　　5) 点击“Import”导入文献。
　　只有最新导入的文献会显示在当前库内，要查看新旧所有文献，单击滑鼠右键的后点击“Show All References”。

　　
　　三、编辑库内文献

　　大多数EndNote的文献管理指令只针对当前显示在库内的文献，对隐藏的文献无效。首先选取库内感兴趣的文献，EndNote支持使用Ctrl和Shift键选取多个文献。接下来的操作与Word相似。
　　1 显示和隐藏文献：在“References”菜单或滑鼠右键菜单内点击“Show Selected References”、“Hide selected References”或“Show All References”，可以仅显示所选文献或隐藏所选文献，或者显示所有文献。
　　2 在库内查找文献：在“References”菜单或滑鼠右键菜单内点击“Search References”
　　，出现检索栏，选择检索项，输入检索词，点击“Search”获得结果。
　　3 添加删除文献：copy、cut、paste、输入新文献
　　4 编辑修改文献
　　5 对文献排序
　　6 改变文献显示的样式
　　7 在库内文献中加入图片、表格和其他映像文件
　　8 查找重复文献
　　

　　四、合并文献库

　　1 将一个文献库内的文献导入到另一个库：按照文献导入步骤，只是要在“Import Options”下拉菜单中选择“EndNote Library”。在导入之前最好将源库和目的库都做好备份，以防数据的改变带来不利后果。映像不会随文献导入到新库中，必须将保存在源库的.DATA文件夹内的映像文件拷贝到目的库的.DATA文件夹里。
　　注意：如果从当前文献库内导入文献到目的库，被导入的文献将只会是当前库内显示出来的文献，隐藏的文献不会被导入。
　　2 拖拽：在源库中选定要转移的文献，直接用滑鼠左键托拽文献到目的库。同样，操作前应备份。
　　3 拷贝和粘贴：在源库内用“Copy”命令拷贝文献，在目的库中用“Paste”粘贴。同样，操作前应备份。
　　注意：备份是又必要的，尤其是当你在用EndNote书写文章时，插入引文的记录号直接与库内文献关联。一旦库内文献改变了，文献记录号也会改变，很有可能影响到文章里插入文献的正确性。
　　功能三 利用EndNote7.0写文章
　　EndNote在安装时可以自动整合到Word 97、2000、XP中，使用者可以简单轻松地将EndNote7.0的库内文献加入到Word文档里，进而格式化引文形成合乎杂志要求的引文样式。另外EndNote7.0提供各种文稿的模板，写文章实现了流水线模块化。
　　注意：最好先安装Word后再安装EndNote7.0，反之有可能不整合。解决办法是重装EndNote7.0。
　　文稿模板：EndNote 提供了大量合乎各种杂志要求的稿件模板，收集在“Templates folder”里，写文章时选择合适的模板可大大简化写作过程。文稿模板经过了格式化，对页边距、标题、行距、首页、摘要、图形位置、字型字号等都做了规范。
　　用模板书写文章的流程：
　　1. 打开模板：从EndNote里打开:点击“Tools”下拉菜单里的“Manuscript Templates”后选择模板； 或者从Word里打开：“新建” “通用模板” “EndNote” 选择模板。
　　2.模板在Word里打开后，出现“Template Wizard”
　　3. 依次填写“Template Wizard”所要求的信息，Template Wizard会将其转入到文章合适的位置。
　　4.填写完后点击“Finish”，进入Word里的模板。
　　5.按照版式填写。
　　“Cite While You Write”是EndNote7.0里与Word整合的元件，可以直接从Word的“工具”菜单里找到和使用。
　　“Cite While You Write”里的选项：
　　1.Find Citation(s): 用于打开“EndNote Find Citations”对话框搜索和插入库内文献，其搜索方式是“任何字段”式的。
　　2. Go To EndNote: 打开EndNote
　　3. Format Bibliography: 对引文样式进行格式化。格式化就是将当前临时的引文转化成一定格式的引文，同时在文章结尾处自动生成引文列表。在缺省设置时即时格式化（“Instant Formatting”）是启动的，随时对插入的引文进行格式转换。引文的输出样式设置可以自己修改。
　　4. Insert Selected Citations: 插入在已经打开的EndNote 文献库内所选定的文献。一次最多插入50篇。
　　5. Edit Citations: 打开“Edit Citation”对话框编辑引文。例如省略作者和年代、添加前缀后缀等。
　　6. Insert Note: 添加注释（自己定义的引文）
　　7. Edit Library Reference(s): 在Word 里选定引文所在位置后利用本命令进入EndNote自动打开相应文献和编辑。
　　8. Unformat Citation(s): 对一个引文或所有引文去格式化，即恢复到系统缺省的临时引文格式（只含有作者的last name、年代和文献记录号）。
　　9. Remove Field Codes: 去掉文章里所有的EndNote域代码后生成一个新的文件，此时已经格式化的引文和引文列表都以文本的形式存在（之前是域）。这利于投稿。
　　10. Export Traveling Library: 将文章里引用的文献导入到EndNote建立成一个新库。
　　11. Find Figure(s): 在EndNote库内寻找带有映像（即图表或附件）的文献，将该映像插入到文章里光标所在位置，形成文内图表。
　　12. Generate Figure List: 对文内映像重新计次序。当前输出样式决定了映像是紧跟在文中段落后还是位于文章结尾。
　　13. Cite While You Write Preferences: “Cite While You Write”参数设置。

　　
　　一、怎样加入引文

　　1.在Word里将光标移到想加入文献的位置
　　2.找到和插入想加入的文献：
　　（1） 方法一：从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Find Citation(s)”，出现“EndNote Find Citations”对话框。输入要查找的文献字段，点击“Search”。出现检索结果后点选要引用的文献，点击“Insert”，引文即插入到Word文件里。
　　（2） 方法二：从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Go To EndNote”，进入EndNote7.0，打开文献库，点选要加入的文献，回到Word，进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Insert Selected Citation(s)”。也可以把选定的文献直接拖到Word里或者在EndNote里Copy，在Word里粘贴。
　　注意：在缺省设置状态下“Instant Formatting”即“立即格式化”是启动的，每次加入的引文会立刻转换成相应格式，同时在文章结尾自动加上文献列表。 如果“立即格式化”未启动，引文则保持临时引用格式即{第一作者，年代＃记录号}，文章结尾也没有文献列表产生。
　　3.所有引文加入完成以后，从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Format Bibliography”，进入“Format Bibliography”对话框。点击“Browse”选择合适的杂志类型，点击“确定”，EndNote会扫描整个文章将引文转换成该杂志要求的格式。
　　4.编辑引文（基本不用，没事不要瞎改）：对引文的编辑只能在引文格式化之后进行，否则系统会提示找不到可编辑的引文。在引文格式化以后，从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Edit Citation(s)”，出现“Edit Citation”对话框，进行编辑。
　　编辑后要重新格式化才会保存所作更改。
　　Exclude Author: 省略所选引文的作者
　　Exclude Year: 省略所选引文的年代
　　Prefix: 给引文加上前缀
　　Suffix: 给引文加上后缀
　　Pages: 给引文加上页码，在文章内以“@页码”的形式出现在临时格式里
　　上下箭头: 改变引文的顺序
　　5.在已经格式化的文章里可以继续加入引文，加入以后重新格式化，EndNote会对引文重新排序和整合。如果该处原有多个旧引文，EndNote只能在旧有引文之前或之后加入新引文，而不能在旧引文中间加入新引文。
　　注意：对已经格式化的引文，Word里会保持其域代码，此时即使在EndNote的文献库里删除了相应文献，也不会影响到文章。但未格式化的引文只是占位符，不含域代码，如果文献在库里删除了相应文献，EndNote就会找不到文献信息。

　　
　　二、怎样加入注释

　　一些杂志（如Science) 要求在文章结尾加上注释，加入的注释会和引文一样被编号，进而按照出现的顺序出现在文献列表里，也就是成为文献列表的一部分。
　　注意: 只有在以“编号样式（numbered style）”格式化过的文章里加入注释才是有意义的，否则注释只能以全文本形式出现在文章里。
　　加入步骤：
　　1. 在Word里将光标移到想加注释的位置
　　2.从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Insert Note”，出现“EndNote Insert Note”对话框
　　3. 写入注释，字数不限
　　4. 点击OK。注释以临时引文的格式出现在相应位置
　　5. 再次格式化文章，你会看到在文章加入注释的位置出现数字标号，在文献列表里会出现注释的内容注释同样可以用“Edit Citation”编辑，方法同前。
　　注意：加入的注释只能是文本，而且注释里不能出现临时引文格式所用的定界符。

　　
　　三、怎样修改引文格式和参考文献的输出样式

　　一般不作修改，如果确有必要修改：
　　从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Format Bibliography”，进入“Format Bibliography”对话框。对话框包括以下内容：
　　1. Format Bibliography”键下的内容：
　　1) Format document: 显示当前要进行修改的文章
　　2) With output: 选择合适的格式，点击 “Browse”可呈现更多种类格式
　　3) Temporary citation delimiters: 临时引文格式的定界符，缺省为大括号
　　2. “Layout tab” 键下的内容：
　　1) Font and size: 参考文献的字型字号
　　2) Bibliography title: 参考文献列表的标题，一般是“REFERENCES”或“参考文献”
　　3) Text Format: 参考文献列表标题的字型字号
　　4) Start with bibliography number:第一个文献的编号
　　5) First line indent and Hanging indent: 首行缩进和悬挂缩进，同Word
　　6) Line spacing and Space after: 文献内行距和文献间行距Set the line spacing for within a reference and the space after for spacing between references.
　　7) “Instant Formatting”键：启动和停止“立即格式化（Instant Formatting）”，使EndNote在插入引文的同时能/不能对引文进行格式化
　　8) “Libraries Used”键： 显示文章引文的来源库对以上各项进行修改后点击“确定”，EndNote会依据上述参数重新格式化文章，修改引文格式和参考文献的输出样式。
　　注意：自己也可以在文献列表里手动修改文献，但重新格式化的时候这些手动修改不会被保存下来。自己也可以在文献列表后手动填写新文献，但新文献必须位于文献列表域之外，否则也不会被保存。

　　
　　四、怎样加入和格式化图表

　　存储在EndNote库里的映像文件都可以插入到文稿里。除了表格以外，文献里的映像文件在Word里都会被当作图形。表格类型文献里的映像在插入Word时还是被当作表格处理，与图片的编号各自独立。文稿中插入的图片以“（Figure X）”的形式存在，表格以“（Table X）”的形式出现。依据所选择的输出样式，图表可以在插入段落之后出现，或者在文稿结尾的图表列表里出现。
　　加入步骤：
　　1. 进入EndNote打开含有映像文件的库
　　2. 在Word里移动光标至插入位置
　　3. 从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Find Figure(s)”，出现“EndNote Find Figures”对话框
　　4. 写入搜索词，搜索词之间可以用“and”连接。
　　5. 点击“Search”出现搜索结果，选中要加入的文献，点击“Insert”。文章内出现“（Figure X）”，EndNote自动对其进行编号。
　　注意：
　　1. “Instant Format”的设置只对引文有效，对映像文件无效，每次加入的映像文件都会自动格式化。但如果加入之后你又对映像文件作了修改（如剪切、粘贴、删除、移动），你必须从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Generate Figure List”重新对映像进行格式化。
　　2.映像出现的位置由你所选择的输出样式（output style也就是杂志的样式）决定，如果没有事先设置输出样式，系统缺省设置为出现在所加入的段落之后。要选择输出样式，和引文一样，从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Format Bibliography”，进入“Format Bibliography”对话框选择“With output”。
　　3.可以手动调整映像的位置（如剪切、粘贴、删除、移动），但“Generate Figure List”重新格式化时会将映像放回到原先的位置，要使系统保留手动调整结果，进入“Cite While You Write Preferences”的“Figures and Tables”键，选择下面一个选项也就是“记住映像的当前位置”。这样即使重新格式化，映像仍在你想要的位置。
　　4.手动调节映像引用处的位置：选择引用点，包括括号，如（Figure 1），拷贝、剪切或拖拽到新位置。
　　5.和处理引文一样，对映像改动之后都要重新“Generate Figure List”。

　　
　　五、去掉域代码生成纯文本文件

　　现在很多杂志都要求作者提供电子文稿。格式化后的文稿含有大量域代码，有可能与杂志社的软件不兼容，因此提交前需要去掉文稿里的域代码。方法是从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择点击“Remove Field Codes”，出现一个提示框告诉你“该操作将创建一个新的去掉了所有域代码的Word文档，原文件仍然打开且无改动”，点击“确定”将新文件存到指定地点。新文件内容和原文件完全相同，只是无域代码，因此不能再对引文进行格式化。
　　附：域代码的由来和作用：当对文稿进行格式化时，EndNote会自动生成一个随行库（Traveling Library）以隐藏方式植入到文稿，库里含有当前文稿里所有的文献信息（除了注释、摘要、映像和图解外），域代码可以认为就是这个随行库的触角，存在于格式化后的引文周围和内部，含有该引文的信息。因此即使换一台没有EndNote文献库的电脑上，格式化后的文稿也能靠随行库和域代码继续对引文进行修改，而一旦去掉了域代码也就去掉了文献信息。要查看域代码，选中引文所在处（区域呈灰色）点击滑鼠右键选定“切换域代码”，切忌胡乱修改。

　　六、“RTF Document Scan”的使用

　　“RTF Document Scan”可以扫描Word文稿里的参考文献和生成文献列表，好处是在格式化引文之前可以检查引文插入是否有差错。
　　过程：
　　1.按照常规在Word或者模板里写文章和插入引文，但“Instant Format”功能一定要关掉，以使引文都以临时格式（如{Morehouse, 1993 #125}）出现。
　　2.将文件另存为.RTF格式。
　　3.关掉Word。
　　4.进入EndNote，从“Tools”菜单进入“RTF Document Scan”子菜单，在弹出的对话框内选定.RTF格式的文件后打开
　　5.出现Citations in“X.RTF”窗口，引用的文献会按照在文章里出现的先后来显示，如果一个文献被引用了多次，也会在该窗口里显示多次。
　　6.如果引文加入正确，窗口里所有的文献之前的“Matches”栏都应该显示为“1”，意思是EndNote 在库内找到了有且只有一个文献与该引文相合，这时就可以格式化文稿了；如果数字不为1，说明有问题，要检查文稿。
　　7.选择输出样式进行格式化，会生成一个新文件，文件名里会自动带上所选的样式名称，很直观。

二、如何在word中利用endnote进行文献管理

word强大的文字处理功能，广泛用于文字性较多的排版，如图书排版、说明书排版。　　word2007 中引入了Word Reference Builder的特性，其管理引用文献的功能和EndNote是相互竞争的。但目前Word2007的Reference管理功能还不是很成熟(1) Reference引用和输出格式可调整性还比较差，citation的模板也比较少(2)不能和SCI、EI等文献检索机构实现互联(3)不方便在阅读 referenced paper的同时，整理读书笔记以及关联pdf文档。　　所以在以后一段时间内，还是推荐使用EndNote来做自己的文献索引和bibliography的管理。下面step-by-step介绍如何将EndNotes X作为add-in和Word2007整合：　　在Word2007里，用alt+F打开File菜单，然后点击“Word选项”按钮 在弹出的“Word选项”对话框里，在左侧区域选择“信任中心”。然后在右侧区域点击“信任中心设置”按钮 在弹出的“信任中心”对话框里，在左侧区域选择“受信任位置”。然后激活右侧区域里的“...\Microsoft\Word\Startup Word 2007默认位置：启动” 注意这个路径就是用来放置word启用时加载的那些add-in的地方。记住这个url。并在explorer里打开它。 关闭所有正在运行的Word, Outlook 等office组件 再用一个explorer,导向到EndNote X的安装目录，如C:\Program Files\EndNote X 从到EndNote X的安装目录下，找到文件EN10CWYW.dot和EN10Cwyw.WordXP.wll。 将这两个文件拷贝到step 4打开的word startup folder。 启动Word2007。在Add-in加载项菜单里就可以看见EndNote X的工具栏了。　　如果觉得EndNote自带的Connection和Template还不够丰富，可以到如下链接去下载　　文章链接：EndNote使用简介　　文献管理和论文写作的利器！虽然讲的是7.0的使用，对8.0的变化也不大　　EndNote　　简 介　　Endnote 由Thomson Corporation下属的Thomson ResearchSoft 开发。 Thomson Researc　　hSoft是以学术信息市场化和开发学术软件为宗旨的子公司。Thomson Corporation总部位　　于美国康涅狄格州的Stamford。　　Endnote的功能　　一、在线搜索文献：直接从网络搜索相关文献并导入到Endnote的文献库内　　二、建立文献库和图片库：收藏，管理和搜索个人文献和图片、表格　　三、定制文稿：直接在Word中格式化引文和图形，利用文稿模板直接书写合乎杂志社要求的文章　　功能一 在线搜索文献　　Endnote利用Z39.50信息获取协议可以方便进入全世界绝大多数的文献数据库，并将连接和搜索这些数据库的信息用“Connection Files”的形式储存起来直接提供给使用者。 Con nection Files的设置可以自己创建或修改　　搜索过程：　　1.进入Endnote7.0，从“Tools”菜单下点击“Connect”　　2.出现“Choose A Connection File”对话框，选定数据库，点击“Connect”　　3.按照布尔逻辑设定搜索词，点击“Search”　　4.出现搜索结果，存入指定的文献库　　提示：　　1.通过点击“Find” 进行查找设置可以提高对某一类型数据库的查找效率　　2.很多数据库需要输入帐号和密码　　3.“ Save Search”可以保存搜索设置；“Load Search”可以导入已保存的搜索设置；“　　Add Field” 和“Delete Field”分别添加和删除设置栏　　功能二 管理库内文献　　一、导出文献　　EndNote库内的文献可以以4种格式导出：Rich Text Format (RTF), HTML, XML, 和 plain text documents（TXT）。从而创建独立的文献集或者创建可以导入到其他数据库的参考文献。导出的文献样式由当前样式决定，当前样式可以从“Edit”菜单下的“Output Styles”或者工具栏上的样式下拉框选定。　　导出步骤：　　1.选定要导出的文献库　　2.按照自己的要求排列文献的顺序　　3.选择合适的文献样式　　4.从 “File”菜单下点选“Export”.　　6.出现导出对话框，选择要保存的文件格式.rtf .html .XML .txt 和文件名　　7. 保存　　注意: 如果文献库内有图像的话，图像将不会随之导出。只能另外粘贴。　　二、导入文献　　EndNote可以将不同来源的文献导入到已存在的库内或新建的库中：　　A. Online searching： 即通过EndNote直接进入网上数据库查找和获得文献　　B. Direct Export：很多网络数据库如MEDLINE、Pubmed、CSA等都支持将自己选择的文献　　以EndNote可识别的格式下载　　C. CD-ROM：将CD内的文献转换为文本格式以后通过滤镜导入　　滤镜：滤镜用于导入网络数据库、CD-ROM和任何含有能够说明文件内信息的标签的文本文档。实际上“Connection files”里也含有滤镜。滤镜的功能是在导入时使EndNote能够解读常规的数据资料，相当于一个解读器。它将文献资料内的信息投射到EndNote 相应的信息域。由于每个特定的数据库都是由供应商以各自的数据组织方式提供的，因此即使供应商相同，每个数据库都需要一个特定的滤镜，不能混用。EndNote自带的滤镜已经经过设定，可以导入相应数据库的资料。使用者也可以编辑滤镜或新建以适应新的数据库或者自用。　　文本文献的导入过程：　　1. 创建EndNote可以导入的文本文件：文件必须是“标注格式（Tagged Format）”的.txt文档，即不同的信息必须以特定的标注（如Tab键、//等记号）分隔归类，每一个标注及其后面的信息都另起一行。自己创建相当麻烦。多数数据库支持将其数据资料转换为Tagged格式。如何转换见滤镜选择对话框下面的“Comments”内容或者“帮助”里的“ImportFormat”。如Pubmed的文献转换为：　　PMID- 15492285　　OWN - NLM　　STAT- In-Process　　DA - 20041019　　IS - 0008-5472　　VI - 64　　IP - 20　　DP - 2004 Oct 15　　TI - CC chemokine ligand 25 enhances resistance to apoptosis in CD4+ T cells　　from patients with T-cell lineage acute and chronic lymphocytic leukemia　　by means of livin activation.　　PG - 7579-87　　AB - We investigated CD4 and CD8 double-positive thymocytes, CD4(+) T cells from typical patients with T-cell lineage acute lymphocytic leukemia(T-ALL) and T cell lineage chronic lymphocytic leukemia (T-CLL), and MOLT4 T cells in terms of CC chemokine igand 25 (CCL25) functions of induction of resistance to tumor necrosis factor alpha (TNF-alpha)-mediated apoptosis.　　AD - Department of Immunology, and Laboratory of Allergy and Clinical Immunology, Institute of Allergy and Immune-related Diseases and Center for Medical Research, Wuhan University School of Medicine, Wuhan, Republic of China.　　FAU - Qiuping, Zhang　　AU - Qiuping Z　　FAU - Jei, Xiong　　AU - Jei X　　FAU - Youxin, Jin　　AU - Youxin J　　LA - eng　　PT - Journal Article　　PL - United States　　TA - Cancer Res　　JID - 2984705R　　SB - IM　　EDAT- 2004/10/20 09:00　　MHDA- 2004/10/20 09:00　　AID - 64/20/7579 [pii]　　AID - 10.1158/0008-5472.CAN-04-0641 [doi]　　PST - ppublish　　SO - Cancer Res 2004 Oct 1564(20):7579-87.　　2. 点选“File”菜单里的“Import”，出现Import对话框　　1) 点击“Choose File”选择要导入的文献数据　　2) 选择“Import Options”下拉菜单里各项：　　EndNote Library: 将EndNote的一个文献库导入到另一个文献库。映像不会随之转移，导入完成过后需要将该映像文件拷贝到新文献库内。　　EndNote Import: 将从网络数据库下载或从EndNote导出并转换成EndNote格式的文本导入到新的EndNote文献库。　　Refer/BibIX: 将从Refer 或 BibIX程序导出的文本导入到EndNote　　ProCite: 将从ProCite 导出的文本导入到EndNote　　Tab Delimited: 用于导入信息域已经被跳格键（Tab）分隔的文本　　Reference Manager (RIS): 可导入从Reference Manager, Reference Update, Referenc e Web Poster 和其他任何RIS 格式资源导出的文档。用EndNote 也可以打开Reference Manager 的文献库。　　ISI-CE: 导入来自于ISI数据资源的文本文档　　Multi-filter (Special): 用于导入含有不同来源文献的文档 EndNote generated XML: 用于从EndNote导出的XML 格式的文件　　Other Filters: 进入“Choose A Filter”对话框看到EndNote自带的大量滤镜，对应于不同的网络数据库。记住每个数据库都需要一个特定的滤镜，即使供应商相同也不可混用。　　Use Connection File:可以将一个connection file作为滤镜。当用EndNote的Connect命令搜索某一数据库时会生成Connect.log文件，将此文件导入成文献库数据。该Connect.log 应该包含all references from your previous session。　　3) 选择“Duplicates”下拉菜单：　　Import All:导入所有文献，包括与目的库内有重复的文献　　Discard Duplicates: 导入文献时剔除与目的库内有重复的文献　　Import into Duplicates Library: 导入文献到目的库，但将所有重复文献放入一个名为“File-Dupl.enl”的库中，“File”是目的库的库名。使用者可以在稍后浏览这些文献或者合并两个库。　　4) 选择“Text Translation”菜单：通常选择“No Translation”，只有机读目录(美国国会图书馆发行的磁带版图书目录，即MARC格式)的文档选择“ANSEL”　　5) 点击“Import”导入文献。　　只有最新导入的文献会显示在当前库内，要查看新旧所有文献，单击滑鼠右键的后点击“Show All References”。　　　　三、编辑库内文献　　大多数EndNote的文献管理指令只针对当前显示在库内的文献，对隐藏的文献无效。首先选取库内感兴趣的文献，EndNote支持使用Ctrl和Shift键选取多个文献。接下来的操作与Word相似。　　1 显示和隐藏文献：在“References”菜单或滑鼠右键菜单内点击“Show Selected References”、“Hide selected References”或“Show All References”，可以仅显示所选文献或隐藏所选文献，或者显示所有文献。　　2 在库内查找文献：在“References”菜单或滑鼠右键菜单内点击“Search References”　　，出现检索栏，选择检索项，输入检索词，点击“Search”获得结果。　　3 添加删除文献：copy、cut、paste、输入新文献　　4 编辑修改文献　　5 对文献排序　　6 改变文献显示的样式　　7 在库内文献中加入图片、表格和其他映像文件　　8 查找重复文献　　　　四、合并文献库　　1 将一个文献库内的文献导入到另一个库：按照文献导入步骤，只是要在“Import Options”下拉菜单中选择“EndNote Library”。在导入之前最好将源库和目的库都做好备份，以防数据的改变带来不利后果。映像不会随文献导入到新库中，必须将保存在源库的.DATA文件夹内的映像文件拷贝到目的库的.DATA文件夹里。　　注意：如果从当前文献库内导入文献到目的库，被导入的文献将只会是当前库内显示出来的文献，隐藏的文献不会被导入。　　2 拖拽：在源库中选定要转移的文献，直接用滑鼠左键托拽文献到目的库。同样，操作前应备份。　　3 拷贝和粘贴：在源库内用“Copy”命令拷贝文献，在目的库中用“Paste”粘贴。同样，操作前应备份。　　注意：备份是又必要的，尤其是当你在用EndNote书写文章时，插入引文的记录号直接与库内文献关联。一旦库内文献改变了，文献记录号也会改变，很有可能影响到文章里插入文献的正确性。　　功能三 利用EndNote7.0写文章　　EndNote在安装时可以自动整合到Word 97、2000、XP中，使用者可以简单轻松地将EndNote7.0的库内文献加入到Word文档里，进而格式化引文形成合乎杂志要求的引文样式。另外EndNote7.0提供各种文稿的模板，写文章实现了流水线模块化。　　注意：最好先安装Word后再安装EndNote7.0，反之有可能不整合。解决办法是重装EndNote7.0。　　文稿模板：EndNote 提供了大量合乎各种杂志要求的稿件模板，收集在“Templates folder”里，写文章时选择合适的模板可大大简化写作过程。文稿模板经过了格式化，对页边距、标题、行距、首页、摘要、图形位置、字型字号等都做了规范。　　用模板书写文章的流程：　　1. 打开模板：从EndNote里打开:点击“Tools”下拉菜单里的“Manuscript Templates”后选择模板； 或者从Word里打开：“新建” “通用模板” “EndNote” 选择模板。　　2.模板在Word里打开后，出现“Template Wizard”　　3. 依次填写“Template Wizard”所要求的信息，Template Wizard会将其转入到文章合适的位置。　　4.填写完后点击“Finish”，进入Word里的模板。　　5.按照版式填写。　　“Cite While You Write”是EndNote7.0里与Word整合的元件，可以直接从Word的“工具”菜单里找到和使用。　　“Cite While You Write”里的选项：　　1.Find Citation(s): 用于打开“EndNote Find Citations”对话框搜索和插入库内文献，其搜索方式是“任何字段”式的。　　2. Go To EndNote: 打开EndNote　　3. Format Bibliography: 对引文样式进行格式化。格式化就是将当前临时的引文转化成一定格式的引文，同时在文章结尾处自动生成引文列表。在缺省设置时即时格式化（“Instant Formatting”）是启动的，随时对插入的引文进行格式转换。引文的输出样式设置可以自己修改。　　4. Insert Selected Citations: 插入在已经打开的EndNote 文献库内所选定的文献。一次最多插入50篇。　　5. Edit Citations: 打开“Edit Citation”对话框编辑引文。例如省略作者和年代、添加前缀后缀等。　　6. Insert Note: 添加注释（自己定义的引文）　　7. Edit Library Reference(s): 在Word 里选定引文所在位置后利用本命令进入EndNote自动打开相应文献和编辑。　　8. Unformat Citation(s): 对一个引文或所有引文去格式化，即恢复到系统缺省的临时引文格式（只含有作者的last name、年代和文献记录号）。　　9. Remove Field Codes: 去掉文章里所有的EndNote域代码后生成一个新的文件，此时已经格式化的引文和引文列表都以文本的形式存在（之前是域）。这利于投稿。　　10. Export Traveling Library: 将文章里引用的文献导入到EndNote建立成一个新库。　　11. Find Figure(s): 在EndNote库内寻找带有映像（即图表或附件）的文献，将该映像插入到文章里光标所在位置，形成文内图表。　　12. Generate Figure List: 对文内映像重新计次序。当前输出样式决定了映像是紧跟在文中段落后还是位于文章结尾。　　13. Cite While You Write Preferences: “Cite While You Write”参数设置。　　　　一、怎样加入引文　　1.在Word里将光标移到想加入文献的位置　　2.找到和插入想加入的文献：　　（1） 方法一：从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Find Citation(s)”，出现“EndNote Find Citations”对话框。输入要查找的文献字段，点击“Search”。出现检索结果后点选要引用的文献，点击“Insert”，引文即插入到Word文件里。　　（2） 方法二：从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Go To EndNote”，进入EndNote7.0，打开文献库，点选要加入的文献，回到Word，进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Insert Selected Citation(s)”。也可以把选定的文献直接拖到Word里或者在EndNote里Copy，在Word里粘贴。　　注意：在缺省设置状态下“Instant Formatting”即“立即格式化”是启动的，每次加入的引文会立刻转换成相应格式，同时在文章结尾自动加上文献列表。 如果“立即格式化”未启动，引文则保持临时引用格式即{第一作者，年代＃记录号}，文章结尾也没有文献列表产生。　　3.所有引文加入完成以后，从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Format Bibliography”，进入“Format Bibliography”对话框。点击“Browse”选择合适的杂志类型，点击“确定”，EndNote会扫描整个文章将引文转换成该杂志要求的格式。　　4.编辑引文（基本不用，没事不要瞎改）：对引文的编辑只能在引文格式化之后进行，否则系统会提示找不到可编辑的引文。在引文格式化以后，从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Edit Citation(s)”，出现“Edit Citation”对话框，进行编辑。　　编辑后要重新格式化才会保存所作更改。　　Exclude Author: 省略所选引文的作者　　Exclude Year: 省略所选引文的年代　　Prefix: 给引文加上前缀　　Suffix: 给引文加上后缀　　Pages: 给引文加上页码，在文章内以“@页码”的形式出现在临时格式里　　上下箭头: 改变引文的顺序　　5.在已经格式化的文章里可以继续加入引文，加入以后重新格式化，EndNote会对引文重新排序和整合。如果该处原有多个旧引文，EndNote只能在旧有引文之前或之后加入新引文，而不能在旧引文中间加入新引文。　　注意：对已经格式化的引文，Word里会保持其域代码，此时即使在EndNote的文献库里删除了相应文献，也不会影响到文章。但未格式化的引文只是占位符，不含域代码，如果文献在库里删除了相应文献，EndNote就会找不到文献信息。　　　　二、怎样加入注释　　一些杂志（如Science) 要求在文章结尾加上注释，加入的注释会和引文一样被编号，进而按照出现的顺序出现在文献列表里，也就是成为文献列表的一部分。　　注意: 只有在以“编号样式（numbered style）”格式化过的文章里加入注释才是有意义的，否则注释只能以全文本形式出现在文章里。　　加入步骤：　　1. 在Word里将光标移到想加注释的位置　　2.从Word的工具栏里进入“EndNote 7.0”子菜单选择“Insert Note”，出现“EndNote Insert Note”对话框　　3. 写入注释，字数不限　　4. 点击OK。注释以临时引文的格式出现在相应位置　　5. 再次格式化文章，你会看到在文章加入注释的位置出现数字标号，在文献列表里会出现注释的内容注释同样可以用“Edit Citation”编辑，方法同前。　　注意：加入的注释只能是文本，而且注释里不能出现临时引文格式所用的定界符。

三、ctex写好的论文如何快速换成别的杂志模板格式

tex 和 doc 格式的相互转换推荐 pandoc，
这是一款强大彪悍的开源软件，
代表了业界最先进的文档转换实力。
只要不是用了 mdwtools 这种高端宏包，
都可以相互转换，正确率大概85%吧，
需要手动微调。

不同的 tex 格式之间的转换很简单，
直接修改 \documentclass{} 就可以了。
一般收 latex 稿件杂志社提供有 cls 文件，
你需要做的只是调用，而且它们要求比较松散，
不用担心排版很爽的，比如物理学报。

偶尔也有某学报，
比较奇葩还定义了一堆的\zihao命令，
调用了绝版的宏包模版，令人痛苦。
这种情况找淘宝店的，
大概几百块让他们帮忙改改就是了。

有一家很好的店，但是写出来怕有做广告的嫌疑，就不发了。。